Nukleoporin

N-terminal nukleoporina 133/155
Domen ima 7-oštričnu beta-propeler strukturu (PDB 1XKS).
Identifikatori
Simbol	Nucleoporin_N

C-terminal nukleoporina 133/155 (ACE2)
NUP133 (ovdje desni domen) komunicira sa NUP107 (PDB 3CQC).
Identifikatori
Simbol	Nucleoporin_C
PDB	3I4R

Nukleoporini su porodica proteina koji su sastavni blokovi kompleksa jedrovih pora (NPC).^[1] Kompleks jedarnih pora je masivna struktura ugrađena u jedarnu ovojnicu na mjestima gdje se spajaju unutrašnja i vanjska jedrova membrana, tvoreći kapiju koja regulira protok makromolekula između jedra i citoplazme. Jedarne pore omogućuju pasivni i olakšani transport molekula preko jedarne ovojnice. Nukleoporini, porodica od oko 30 proteina, glavne su komponente kompleksa jedarnih pora u eukariotskim ćelijama. Nukleoporin 62 je najbrojniji član ove porodice.^[2] Nukleoporini su sposobni transportirati molekule preko jedrove ovojnice vrlo velikom brzinom. Jedan NPC može prenijeti i oko 60.000 molekula proteina kroz jedrovu ovojnicu svake minute.^[3]

Biohemijska svojstva i kristalna struktura

Chug et al. (2015) izvijestili su o strukturnoj analizi kompleksa Nup62-Nup58-Nup54, koji je ključna komponenta transportnog sistema nukleoplazme. Sastoji se od trimernog sučelja dugog približno 13 nanometara s neobičnim zavojnicom 2W3F, kanonskom heterotrimernom zavojnicom i pregibom koji provodi kompaktni snop od šest alfa-heliks. Nup54 također sadrži domen sličan feredoksinu (103260). Dalje su identificirali heterotrimerni modul za vezanje Nup93, za sidrenje jedarnih pora (NPC). Izmjene kvaternarne strukture u kompleksu Nup62, za koje je predloženo da pokreću opće otvaranje NPC -a, nisu kompatibilne sa trimernom strukturom. Sugerirali su da se visoko izduženi kompleks Nup62 projicira tako da stvarajući barijeru FG (phe-gly) ponavlja se daleko u središnji NPC kanal, podržavajući barijeru koja štiti cijeli presjek.^[4]

1. ^ Doye V, Hurt E (June 1997). "From nucleoporins to nuclear pore complexes". Current Opinion in Cell Biology. 9 (3): 401–11. doi:10.1016/S0955-0674(97)80014-2. PMID 9159086.
2. ^ Han I, Oh ES, Kudlow JE (August 2000). "Responsiveness of the state of O-linked N-acetylglucosamine modification of nuclear pore protein p62 to the extracellular glucose concentration". The Biochemical Journal. 350 Pt 1: 109–14. doi:10.1042/0264-6021:3500109. PMC 1221231. PMID 10926833.
3. ^ Greška kod citiranja: Nevaljana oznaka <ref>; nije naveden tekst za reference s imenom Lodish_2013
4. ^ Chug, H., Trakhanov, S., Hulsmann, B. B., Pleiner, T., Gorlich, D. Crystal structure of the metazoan Nup62-Nup58-Nup54 nucleoporin complex. Science 350: 106-110, 2015. PubMed: 26292704