RefSeq

Referentna sekvenca
Logo baze podataka
Skraćenica	RefSeq
Nasljednik	Novoosnovana
Datum osnivanja	Septebar 2017.
Vrsta	Kurirana baza podataka genoma bez redundantnih sekvenci
Status	Aktivna
Cilj	Baza podataka sekvenci DNK i RNK
Glavno sjedište	Nacionalni centar za biotechnološke informacije
Članstvo	Globalno
Jezik	Engleski
Glavni organ	Citiranje: Pruitt KD & al. (2005)[1]
Br. volontera	Neograničen
Veb-sajt	www.ncbi.nlm.nih.gov/RefSeq%20www.uniprot.org

Referentna sekvenca (RefSeq) baza podataka^[1] je otvorenog pristupa, označena i kurirana kolekcija javno dostupnih nukleotidnih sekvenci (DNK, RNK) i njihovih proteinskih proizvoda. RefSeq je prvi put predstavljen 2000.^[2][3] Ovu bazu podataka napravio je Nacionalni centar za biotehnološke informacije (NCBI) i, za razliku od GenBank, pruža samo jedan zapis za svaku prirodnu biološku molekulu (tj. DNK, RNK ili protein) za glavne organizme u rasponu od virusa i bakterija do eukariota.

Za svaki modelni organizam, RefSeq ima za cilj da obezbijedi zasebne i povezane zapise za genomsku DNK, transkripte gena i proteine koji proizlaze iz tih transkripata. RefSeq ograničen je na glavne organizme za koje je dostupno dovoljno podataka (više od 66.000 različitih „imenovanih“ organizama od septembra 2011.),^[4] dok GenBank uključuje sekvence za bilo koji podneseni organizam (približno 250.000 različitih imenovanih organizama).

1. ^ ^{a b} Pruitt KD, Tatusova T, Maglott DR (January 2005). "NCBI Reference Sequence (RefSeq): a curated non-redundant sequence database of genomes, transcripts and proteins". Nucleic Acids Research. 33 (Database issue): D501-4. doi:10.1093/nar/gki025. PMC 539979. PMID 15608248.
2. ^ Maglott DR, Katz KS, Sicotte H, Pruitt KD (January 2000). "NCBI's LocusLink and RefSeq". Nucleic Acids Research. 28 (1): 126–8. doi:10.1093/nar/28.1.126. PMC 102393. PMID 10592200.
3. ^ Pruitt KD, Katz KS, Sicotte H, Maglott DR (January 2000). "Introducing RefSeq and LocusLink: curated human genome resources at the NCBI". Trends in Genetics. 16 (1): 44–7. doi:10.1016/s0168-9525(99)01882-x. PMID 10637631.
4. ^ RefSeq Release 80 Statistics (Report). National Library of Medicine. 2017. Pristupljeno 13 January 2017.