Ribosomski protein

Velika ribosomska podjedinica (PDB 1FFK).

Mala ribosomska podjedinica (PDB 1FKA).

Dvije ribosomske podjedinice. Proteini su prikazani plavom bojom, a lanci RNK smeđom i žutom.

Ribosomski protein (r-protein ili rProtein^[1][2][3]) je bilo koji od proteina koji, zajedno sa rRNL, čine ribosomskee podjedinice uključene u ćelijski proces translacijom. E. coli i ostale bakterije i Archaea imaju 30S malu podjedinicu i 50S veliku podjedinicu, dok ljudi i kvasci imaju 40S malu podjedinicu i 60S veliku podjedinicu.^[4] Ekvivalentne podjedinice se često različito numeriraju između bakterija, arheja, kvasaca i ljudi.^[5]

Veliki dio znanja o ovim organskim molekulama došao je iz proučavanja ribosoma E. coli. Svi ribosomski proteini su izolovani i proizvedena su mnoga specifična antitijela. Ovo, zajedno sa elektronskom mikroskopoijom i upotrebom određenih reaktivnih tvari, omogućilo je određivanje topografije proteina u ribosomu. U novije vrijeme, skoro potpuna (skoro)atomska slika ribosomskih proteina izlazi iz najnovijih krio-EM podataka visoke rezolucije (uključujući PDB 5AFI).

1. ^ Salini Konikkat: Dynamic Remodeling Events Drive the Removal of the ITS2 Spacer Sequence During Assembly of 60S Ribosomal Subunits in S. cerevisiae. Arhivirano 3. 8. 2017. na Wayback Machine Carnegie Mellon University Dissertations, Feb. 2016.
2. ^ Weiler EW, Nover L (2008). Allgemeine und molekulare Botanik (jezik: njemački). Stuttgart: Georg Thieme Verlag. str. 532. ISBN 978-3-13-152791-2.
3. ^ de la Cruz J, Karbstein K, Woolford JL (2015). "Functions of ribosomal proteins in assembly of eukaryotic ribosomes in vivo". Annual Review of Biochemistry (jezik: njemački). 84: 93–129. doi:10.1146/annurev-biochem-060614-033917. PMC 4772166. PMID 25706898.
4. ^ Rodnina MV, Wintermeyer W (April 2011). "The ribosome as a molecular machine: the mechanism of tRNA-mRNA movement in translocation". Biochemical Society Transactions. 39 (2): 658–62. doi:10.1042/BST0390658. PMID 21428957.
5. ^ Ban N, Beckmann R, Cate JH, Dinman JD, Dragon F, Ellis SR, et al. (February 2014). "A new system for naming ribosomal proteins". Current Opinion in Structural Biology. 24: 165–9. doi:10.1016/j.sbi.2014.01.002. PMC 4358319. PMID 24524803.