Shema sinaptonemskog kompleksa u različitim fazama tokom profaze IA: Homologni hromosomi (svijetlo plavi) se poravnavaju i sinapse zajedno preko poprečnih filamenata (crne linije) i uzdužnih filamenata (tamnoplavi). Rekombinacijski čvorovi (sivi elipsoidi) na centralnoj regiji mogu pomoći u dovršavanju rekombinacije. Hromatin (crvene petlje) je pričvršćen za njegovu spolnu nogu i nožni prst, koji se proteže od obje sestrinske hromatide. B' Vrh: Set paradajz SC-a. Oko svakog SC-a vidljivi su hromatinski "omoti". Dole: dva paradajz SC-a sa uklonjenim hromatinom, omogućavajući otkrivanje kinetohora ("loptastih" struktura) na centromerama.
^Page SL, Hawley RS (8. 10. 2004). "The genetics and molecular biology of the synaptonemal complex". Annual Review of Cell and Developmental Biology. 20 (1): 525–58. doi:10.1146/annurev.cellbio.19.111301.155141. PMID15473851.