Format FASTQ

Infotaula de format de fitxerFormat FASTQ
Tipusformat de fitxer i textual data format (en) Tradueix Modifica el valor a Wikidata
Extensiófastq i fq Modifica el valor a Wikidata
MIMEtext/plain Modifica el valor a Wikidata
Magic number405345515F4944 Modifica el valor a Wikidata
DesenvolupadorWellcome Sanger Institute (en) Tradueix Modifica el valor a Wikidata
Extensió deformat FASTA Modifica el valor a Wikidata

El format FASTQ és un format de text pla utilitzat per emmagatzemar seqüències biològiques (normalment de nucleòtids) juntament amb llurs puntuacions de qualitat. Tant la lletra de la seqüència com la puntuació de qualitat estan codificades amb un únic caràcter ASCII per brevetat. Va ser dissenyat originalment al Wellcome Trust Sanger Institute per tal d'empaquetar les seqüències FASTA juntament amb les dades de qualitat.

Actualment podríem considerar que és l'estàndard de facto per tal d'emmagatzemar dades d'instruments de seqüenciació massiva.[1]

  1. Cock, P. J. A.; Fields, C. J.; Goto, N.; Heuer, M. L.; Rice, P. M. «The Sanger FASTQ file format for sequences with quality scores, and the Solexa/Illumina FASTQ variants». Nucleic Acids Research, 38, 6, 2009, pàg. 1767–1771. DOI: 10.1093/nar/gkp1137. PMC: 2847217. PMID: 20015970.

From Wikipedia, the free encyclopedia · View on Wikipedia

Developed by Nelliwinne