Sonic hedgehog

Sonic hedgehog
Estructures disponibles PDB Cerca ortòloga: PDBe RCSB Llista de codis id de PDB 3HO5, 3M1N, 3MXW
Identificadors
Àlies	SHH (HUGO), HHG1, HLP3, HPE3, MCOPCB5, SMMCI, TPT, TPTPS, sonic hedgehog, Sonic hedgehog, ShhNC, sonic hedgehog signaling molecule
Identif. externs	OMIM: 600725   MGI: 98297   HomoloGene: 30961   GeneCards: SHH   OMA: SHH - orthologs
Malalties relacionades genèticament
holoprosencephaly 3 , Laurin-Sandrow syndrome  [1]
Localització del gen (humà) Cromosoma: 7 (humà)[2] Banda 7q36.3 Inici 155.799.980 bp[2] Fi 155.812.463 bp[2]
Localització del gen (ratolí) Cromosoma: 5 (ratolí)[3] Banda 5 B1|5 14.39 cM Inici 28.661.813 bp[3] Fi 28.672.254 bp[3]
Patró d'expressió d'ARN Bgee humà ratolí (ortòleg) Més explicacions right lobe of liver  pancreatic epithelial cell  nervi sural  right adrenal cortex  left adrenal cortex  testicle mucosa of transverse colon  vesícula biliar bufeta urinària gangli espinal Més explicacions transitional epithelium of urinary bladder  dent queixal dent incisiva oral mucosa  llengua Hindgut  left lung lobe  notocordi epithelium of stomach  Més referències a dades d'expressió BioGPS Més referències a dades d'expressió
Ontologia genètica Funció molecular calcium ion binding  metal ion binding  patched binding  peptidase activity  zinc ion binding  laminin-1 binding  glycosaminoglycan binding  morphogen activity  activitat hidrolasa  unió proteica  endopeptidase activity  Component cel·lular citosol  endoplasmic reticulum lumen  membrana  superfície cel·lular  membrane raft  membrana plasmàtica  extracel·lular  regió extracel·lular  matriu extracel·lular  Procés biològic positive regulation of skeletal muscle cell proliferation  procés d'especificació de patró  myotube differentiation  mesenchymal cell proliferation  male genitalia development  bud outgrowth involved in lung branching  limb bud formation  T cell differentiation in thymus  embryonic pattern specification  positive regulation of skeletal muscle tissue development  positive regulation of immature T cell proliferation in thymus  positive regulation of kidney smooth muscle cell differentiation  negative regulation of Wnt signaling pathway  Formació d'estructures anatòmiques implicades en la morfogènesi  ectoderm development  hindgut morphogenesis  spinal cord dorsal/ventral patterning  formation of anatomical boundary  oligodendrocyte differentiation  trachea development  prostate gland development  negative regulation of transcription elongation from RNA polymerase II promoter  limb development  vasculogenesis  primary prostatic bud elongation  heart looping  telencephalon regionalization  odontogenesis of dentin-containing tooth  positive regulation of mesenchymal cell proliferation  angiogènesi  positive regulation of epithelial cell proliferation involved in prostate gland development  positive regulation of striated muscle cell differentiation  regulació negativa del procés catabòlic de proteïnes dependents d'ubiquitina  embryonic digestive tract morphogenesis  apoptotic signaling pathway  inner ear development  hair follicle morphogenesis  proliferació cel·lular  metanephros development  lung epithelium development  negative regulation of canonical Wnt signaling pathway  regulation of proteolysis  branching involved in salivary gland morphogenesis  negative regulation of mesenchymal cell apoptotic process  positive regulation of neuroblast proliferation  dopaminergic neuron differentiation  intermediate filament organization  renal system development  cell fate commitment  regulació de la transcripció, modelat amb ADN  positive regulation of smoothened signaling pathway  androgen metabolic process  kidney development  lung development  negative regulation of protein catabolic process  thymus development  embryonic organ development  negative regulation of cell differentiation  negative regulation of dopaminergic neuron differentiation  embryonic digit morphogenesis  negative regulation of alpha-beta T cell differentiation  positive regulation of sclerotome development  epithelial-mesenchymal cell signaling  negative regulation of gene expression  lymphoid progenitor cell differentiation  negative thymic T cell selection  positive regulation of transcription, DNA-templated  positive regulation of Wnt signaling pathway  ventral midline development  central nervous system development  heart development  branching involved in ureteric bud morphogenesis  negative regulation of T cell proliferation  embryonic limb morphogenesis  positive regulation of cell differentiation  branching involved in prostate gland morphogenesis  positive regulation of mesenchymal cell proliferation involved in ureter development  establishment of cell polarity  branching involved in blood vessel morphogenesis  positive regulation of cerebellar granule cell precursor proliferation  neuroblast proliferation  pancreas development  positive regulation of protein import into nucleus  smoothened signaling pathway  oligodendrocyte development  camera-type eye development  spinal cord motor neuron differentiation  positive regulation of alpha-beta T cell differentiation  digestive tract morphogenesis  hair follicle development  positive regulation of oligodendrocyte differentiation  roof of mouth development  left lung development  striated muscle tissue development  positive regulation of T cell differentiation in thymus  cellular response to lithium ion  embryonic foregut morphogenesis  desenvolupament d'estructura anatòmica  thalamus development  stem cell development  smoothened signaling pathway involved in regulation of cerebellar granule cell precursor cell proliferation  cell fate specification  negative regulation of apoptotic process  negative regulation of transcription by RNA polymerase II  regulation of nodal signaling pathway involved in determination of lateral mesoderm left/right asymmetry  proteòlisi  embryonic skeletal system development  regulation of protein localization to nucleus  odontogenesis  respiratory tube development  regulation of prostatic bud formation  thyroid gland development  negative regulation of cell migration  creixement de desenvolupament  right lung development  determination of left/right asymmetry in lateral mesoderm  positive thymic T cell selection  mesenchymal smoothened signaling pathway involved in prostate gland development  canonical Wnt signaling pathway  regulació de l'expressió gènica  osteoblast development  negative regulation of cholesterol efflux  dorsal/ventral neural tube patterning  regulation of epithelial cell proliferation involved in prostate gland development  epithelial-mesenchymal signaling involved in prostate gland development  dorsal/ventral pattern formation  branching morphogenesis of an epithelial tube  lung lobe morphogenesis  embryonic forelimb morphogenesis  midbrain development  skin development  regulation of odontogenesis  regulation of mesenchymal cell proliferation involved in prostate gland development  mesenchymal cell proliferation involved in lung development  positive regulation of hh target transcription factor activity  prostate epithelial cord elongation  metanephric mesenchymal cell proliferation involved in metanephros development  endocitosi  lung morphogenesis  cell development  trachea morphogenesis  epithelial cell proliferation involved in salivary gland morphogenesis  cell-cell signaling  salivary gland cavitation  hindbrain development  coagulació de la sang  negative regulation of kidney smooth muscle cell differentiation  somite development  cerebellar granule cell precursor proliferation  guiatge axonal  negative regulation of ureter smooth muscle cell differentiation  positive regulation of ureter smooth muscle cell differentiation  desenvolupament d'organisme multicel·lular  animal organ formation  intein-mediated protein splicing  determination of left/right symmetry  vasculature development  positive regulation of gene expression  regulation of cell population proliferation  embryonic morphogenesis  neural crest cell migration  polarity specification of anterior/posterior axis  positive regulation of cell population proliferation  artery development  protein localization to nucleus  Bergmann glial cell differentiation  forebrain development  neuron fate commitment  CD4-positive or CD8-positive, alpha-beta T cell lineage commitment  striated muscle cell differentiation  myoblast differentiation  lung-associated mesenchyme development  epithelial tube branching involved in lung morphogenesis  positive regulation of cell division  positive regulation of transcription by RNA polymerase II  anterior/posterior pattern specification  embryonic hindlimb morphogenesis  forebrain regionalization  cell proliferation in external granule layer  tracheoesophageal septum formation  regulation of signaling receptor activity  Fonts: Amigo / QuickGO
Ortòlegs Espècies Humà Ratolí Entrez 6469 20423 Ensembl ENSG00000164690 ENSMUSG00000002633 UniProt Q15465 Q62226 RefSeq (ARNm) NM_000193 NM_001310462 NM_009170 RefSeq (proteïna) NP_000184 NP_001297391 NP_033196 Localització (UCSC) Chr 7: 155.8 – 155.81 Mb Chr 5: 28.66 – 28.67 Mb Cerca a PubMed [4] [5]
Wikidata
Veure/Editar gen humà Veure/Editar gen del ratolí

El Sonic hedgehog (SHH) és una proteïna que en humans està codificada pel gen SHH ^[6] És el lligand millor estudiat de la via de senyalització Hedgehog ; d'altres són el desert hedgehog (DHH) i Indian hedgehog (IHH). Té un paper clau en el desenvolupament dels animals, des d'insectes fins a mamífers. En els vertebrats, participa en l'organogènesi, inclòs el creixement dels dits a les extremitats i l'organització del cervell. Sonic hedgehog és un exemple arquetípic de morfogen definit pel model de bandera francesa de Lewis Wolpert: una molècula que es difon per formar un gradient de concentració i que té diferents efectes sobre les cèl·lules de l'embrió en desenvolupament segons la seva concentració. Sonic hedgehog també és actiu en adults; per exemple, controla la proliferació de cèl·lules mare adultes i ha estat implicat en el desenvolupament d'alguns càncers.