National Center for Biotechnology Information

National Center for Biotechnology Information
Logo NCBI
Vznik	4. listopadu 1988
Sídlo	Maryland Route 355 8600, Bethesda, 208 94, Spojené státy americké
Souřadnice	38°59′45″ s. š., 77°5′56″ z. d.
Mateřská organizace	United States National Library of Medicine
Oficiální web	www.ncbi.nlm.nih.gov
multimediální obsah na Commons
Některá data mohou pocházet z datové položky.

National Center for Biotechnology Information (NCBI) neboli Národní centrum pro biotechnologické informace je součástí Národní lékařské knihovny USA v areálu americké agentury National Institutes of Health (NIH, Národní zdravotní instituty). Centrum bylo založeno v roce 1988 a sídlí v areálu NIH v Bethesdě v Marylandu. Ředitelem NCBI byl v minulosti David Lipman, známý svou účastí na výzkumu technologie BLAST, užívané k sekvenaci DNA. V současnosti instituci vede Stephen Sherry, v minulosti řídící vývoj genetických databází NCBI.^[1]

Úlohou NCBI je ukládání, zpracování a anotace vědeckých dat, zejména z oblastí molekulární biologie, medicíny, biochemie a genetiky. Instituce se také aktivně podílí na vyvíjení nástrojů pro analýzu bioinformatických dat. V databázích NCBI se soustřeďují výsledky sekvenací DNA (GenBank), vědecké články (PubMed Central, PubMed), informace o genech (RefSeq, Gene), anotace sekvencí makromolekul (Protein, Nucleotide) nebo mapovací data již osekvenovaných genomů (Genome). Služby NCBI jsou volně dostupné, podobně jako u bioinformatických institutů jako European Bioinformatics Institute (EBI), Swiss Institute of Bioinformatics (SIB) nebo DNA Data Bank of Japan (DDBJ).

Pro tvorbu svých databází využívá NCBI data ukládané vědeckou komunitou manuálně přímo do NCBI nebo získávané jejich výměnou se spřízněnými institucemi jako např. DDBJ, European Molecular Biology Laboratory (EMBL), Protein Information Resource (PIR) nebo vydavateli vědecké literatury. Minoritní podíl na zisku dat tvoří také cílené správcovské aktivity NCBI, data aktivně vkládaná zaměstnanci centra. Množství uložených dat v NCBI roste exponenciálně - v roce 2020 bylo ve všech databázích NCBI celkově uložených přes 3 miliardy záznamů,^[2] v porovnání s přibližně 680 miliony záznamy v roce 2012^[3] a 90 miliony záznamy v roce 2007.^[4] Služby NCBI jsou denně využívány až 4 miliony použivatelů.^[5]

Prohledávání NCBI je zprostředkováno systémem Entrez, kterého výstupem je komplexní záznam získaný z více propojených databází. NCBI také umožňuje prohledávání svých databází za účelem nalezení podobných sekvenci pomocí algoritmu Basic Local Aligment Search Tool (BLAST). Pro stažení všech relevantních dat přirazených k danému databázovému záznamu slouží The Entrez Programming Utilities (E-utilities).