Alphonso Johnson (2. februar 1951 i Philadelphia, Pennsylvania, USA) er en amerikansk elbassist.
Johnson er nok mest kendt for sit virke i fusionsgruppen Weather Report på to plader Mysterious Traveller og Black Market. Han har ligeledes spillet med John Scofield, Billy Cobham, George Duke og Wayne Shorter.
Johnson har lavet tre soloplader i eget navn. Han har været en innovativ bassist på elbassen fra begyndelsen af 1970'erne.[kilde mangler]