EHF Champions League 2003–04 for kvinder var den 11. EHF Champions League-turnering for kvinder. Turneringen blev arrangeret af European Handball Federation og havde deltagelse af 29 hold. Holdene spillede først to kvalifikationsrunder. De otte vindere af anden kvalifikationsrunde gik sammen med otte direkte kvalificerede hold videre til gruppespillet, der bestod af fire grupper med fire hold, hvorfra de fire vindere og fire toere gik videre til kvartfinalerne.
Turneringen blev for første gang vundet af et dansk hold. Slagelse FH vandt i finalen over to kampe samlet 61-56 over Krim Ljubljana fra Slovenien. Ud over de danske mestre fra Slagelse repræsenterede Ikast-Bording EH ligeledes Danmark i turneringen, og det midtjyske hold nåede gruppespillet, hvor det endte på tredjepladsen i gruppe B.