Flandern Rundt for kvinder 2016 var det 13. løb i kvindernes Flandern Rundt, som er et cykelløb i Belgien for kvinder. Løbet blev afholdt den 3. april 2016, som det femte løb i den i 2016 etablerede World Tour sæson over et løb på 141,2 km. Løbet startede og sluttede i Oudenaarde.[1] Britiske Lizzie Armitstead vandt løbet i en spurt mod svenske Emma Johansson.[2]