BLOSUM

BLOSUM (BLOcks SUbstitution Matrix; auch BlOSSUM)^[1] ist eine evidenzbasierte Substitutionsmatrix, die für Sequenzalignment von Proteinen benutzt wird und spielt neben der Point Accepted Mutation Matrix (PAM-Matrix) eine wichtige Rolle in der Bioinformatik. Die BLOSUM wurde 1992 von Jorja G. Henikoff und Steven Henikoff entwickelt. Es existieren verschiedene Matrizen für unterschiedliche evolutionäre Distanzen.^[2]

1. ↑ Im Akronym BLOSUM steht das letzte 'M' bereits für 'Matrix' und deshalb ist es falsch, von einer 'BLOSUM matrix' zu sprechen, da dies ein redundantes Akronym ist.
2. ↑ S. Henikoff, J. G. Henikoff: Amino acid substitution matrices from protein blocks. In: Proceedings of the National Academy of Sciences of the USA. 89(22), 15. Nov 1992, S. 10915–10919. PMID 1438297