Die Basilika ist in Ober- und Unterkirche mit bedeutenden Malereien des Spätmittelalters, unter anderem des Giotto di Bondone, geschmückt. Sie wurde am 26. September 1997 bei einem Erdbeben schwerst beschädigt und mit enormem Aufwand wiederhergestellt.
↑Der Titel Basilika ist bei San Francesco eine kirchliche Rangbezeichnung und nicht zu verwechseln mit dem architektonischen Bautyp Basilika. San Francesco ist bautypologisch eine kreuzförmige Saalkirche mit Unter- und Oberkirche.