Sardar Mohammed Ayub Khan (paschtunisch محمد ايوب خان Mohammad Ayub Chan, * 1857 in Kabul; † 7. April 1914 in Lahore) war 1880 interimistischer Regent Afghanistans, von 1880 bis 1881 Emir von Herat und 1881 Emir von Kandahar. Er war der fünfte Sohn von Emir Schir Ali und Bruder des von Februar bis Oktober 1879 regierenden Emir Mohammed Yakub Khan.