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Japan nahm an den Olympischen Winterspielen 1998 im heimischen Nagano mit einer Delegation von 156 Athleten in allen 14 Disziplinen teil, davon 92 Männer und 64 Frauen. Mit fünf Goldmedaillen, einer Silbermedaille und vier Bronzemedaillen erreichte der Gastgeber Rang sieben im Medaillenspiegel. Erfolgreichster japanischer Teilnehmer war der Skispringer Kazuyoshi Funaki, der auf der Großschanze und mit der Mannschaft Olympiasieger wurde. Auf der Normalschanze gewann er zudem Silber.
Fahnenträger bei der Eröffnungsfeier war der Eisschnellläufer Hiroyasu Shimizu.