Oto Luthar (* 11. August 1959 in Murska Sobota, Jugoslawien, heute Slowenien) ist ein slowenischer Historiker.
Er studierte an der Universität Ljubljana, wo er 1992 promovierte. Seit 1992 ist er Direktor des Wissenschaftlichen Forschungszentrums der Slowenischen Akademie der Wissenschaften und Künste. Daneben lehrte er an der Pädagogischen Fakultät der Universität Maribor. 1999/2000 hatte er eine Gastprofessur an der Yale University.