Sebastian Koto Kardinal Khoarai OMI (* 11. September 1929 in Koaling, Kronkolonie Basutoland; † 17. April 2021 in Mazenod, Lesotho) war ein lesothischer Ordensgeistlicher, römisch-katholischer Bischof von Mohale’s Hoek und Präsident der Bischofskonferenz von Lesotho.