Thomas Flynn ist der Name folgender Personen:
- Thomas Flynn (Bischof, Ardagh) († 1730), irischer römisch-katholischer Bischof von Ardagh
- Thomas Flynn (Bischof, 1931) (1931–2015), irischer römisch-katholischer Bischof von Achonry
- Thomas Flynn (Fußballspieler) (* 1990), schottischer Fußballtorwart
