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| Formato FASTA | ||
|---|---|---|
| Desarrollador | ||
|
David J. Lipman William R. Pearson | ||
| Información general | ||
| Extensión de archivo |
.fasta, .fna, .ffn, .faa, .frn | |
| Tipo de MIME |
| |
| Lanzamiento inicial | 1985 | |
| Tipo de formato | Bioinformática | |
| Extendido de | ASCII | |
| Extendido a | Formato FASTQ | |
| Formato abierto | ? | |
En bioinformática, el formato FASTA es un formato de archivo informático basado en texto, utilizado para representar secuencias de nucleótidos o de aminoácidos (constituyentes de ácidos nucleicos y proteínas, respectivamente), y en el que estos se representan usando códigos de una única letra.
El formato también permite incluir nombres de secuencias y comentarios que preceden a las secuencias en sí.[1] Se originó a partir del software de alineamiento de secuencias FASTA, creado en 1985.[2][3] La simplicidad del formato FASTA hace fácil el manipular y analizar secuencias usando herramientas de procesado de textos y lenguajes de guion como Python y PERL.
- ↑ «FASTA Format for Nucleotide Sequences». www.ncbi.nlm.nih.gov. Archivado desde el original el 19 de febrero de 2024. Consultado el 2 de febrero de 2025.
- ↑ Lipman, D. J.; Pearson, W. R. (22 de marzo de 1985). «Rapid and sensitive protein similarity searches». Science (New York, N.Y.) 227 (4693): 1435-1441. ISSN 0036-8075. PMID 2983426. doi:10.1126/science.2983426. Consultado el 2 de febrero de 2025.
- ↑ Pearson, W. R.; Lipman, D. J. (1988). «Improved tools for biological sequence comparison». Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 85 (8): 2444-2448. ISSN 0027-8424. PMID 3162770. doi:10.1073/pnas.85.8.2444. Consultado el 2 de febrero de 2025.