Joseph Eggleston Johnston (Farmville, 3 de febrero de 1807 - Nueva York, 21 de marzo de 1891) fue un oficial del Ejército de los Estados Unidos, y más tarde de los Estados Confederados. Fue uno de los pocos oficiales confederados que tenían experiencia bélica real, en concreto, Johnston había servido en la Guerra México-Estados Unidos y en las Guerras Seminolas.