Back صيغة فاستا Arabic Format FASTA Catalan FASTA-Format German FASTA format English Formato FASTA Spanish قالب فستا Persian FASTA (format de fichier) French פורמט FASTA HE FASTA 포맷 Korean FASTA format Polish
| FASTA formaat | |
|---|---|
| Failinimelaiendid |
.fasta, .fas, .fa, .fna, .ffn, .faa, .mpfa, .frn |
| Arendajad |
David J. Lipman William R. Pearson |
| Avaldatud | 1985 |
| Valdkond | Bioinformaatika |
| Laiendatud versioon | FASTQ formaat |
| veebileht |
www |
Bioinformaatikas on FASTA tekstipõhine formaat, milles nukleotiidide või aminohapete järjestused esitatakse nendele vastavate ühetäheliste koodide järjestusena. FASTA formaadis järjestus algab ühe kirjeldava koodireaga millele järgnevad read järjestuseandmetega. [1] FASTA formaat võimaldab lisada järjestusele täpsustavaid identifikaatoreid. [2]
FASTA formaat loodi David J. Lipman ja William R. Pearson’i arendatud FASTA tarkvarapaketi raames, mida kirjeldati esimest korda 1985. aastal.[3] Sellel põhjusel nimetatakse FASTA formaati alternatiivselt ka Pearson’i formaadiks.
- ↑ "FASTA format". zhanggroup.org. Vaadatud 8. jaanuaril 2024.
- ↑ "Query Input and database selection — BlastTopics 0.1.1 documentation". blast.ncbi.nlm.nih.gov. Vaadatud 8. jaanuaril 2024.
- ↑ Lipman, David J.; Pearson, William R. (22. märts 1985). "Rapid and Sensitive Protein Similarity Searches". Science (inglise). 227 (4693): 1435–1441. DOI:10.1126/science.2983426. ISSN 0036-8075.