Endofito hitzak «landarearen barruan» esan nahi du, eta landare baten barruan bizi diren organismoak izendatzeko erabili da, harekin duten harremana kontuan hartu gabe. Gehienetan, onddoak edo bakterioak izaten dira endofitoak. Bakterioak eta onddo endofitikoak maiz aztertzen diren arren, arkea endofitikoak gero eta gehiago hartzen dira kontuan landare baten erdiko mikrobiomaren zati gisa landare hazkuntza sustatzeko duten zereginagatik[1].