YTHDC1

YTHDC1
ساختارهای موجود PDB جستجوی هم‌ساخت‌شناسی: PDBe RCSB فهرست شناسه‌های PDB 2YUD, 4R3H, 4R3I
معین‌کننده‌ها
نام‌های دیگر	YTHDC1, YT521, YT521-B, YTH domain containing 1
شناسه‌های بیرونی	OMIM: 617283 MGI: 2443713 HomoloGene: 15796 GeneCards: YTHDC1
موقعیت ژن (موش) کروموزوم کروموزوم ۵ (موش)[۱] نوار 5|5 E1 شروع 86,952,080 bp[۱] پایان 86,984,518 bp[۱]
الگوی گسترش RNA More reference expression data
هستی‌شناسی ژن عملکرد ملکولی • GO:0001948، GO:0016582 پیوند پروتئینی • RNA binding • N6-methyladenosine-containing RNA binding ترکیبات سلولی • هسته یاخته • nuclear speck • پوسته یاخته • نوکلئوپلاسم فرایند زیستی • mRNA processing • mRNA splice site selection • پیرایش آران‌ای • regulation of mRNA splicing, via spliceosome • mRNA export from nucleus • dosage compensation by inactivation of X chromosome • posttranscriptional regulation of gene expression منابع: آمیگو / کوئیک‌گو
هم‌ساخت‌شناسی
گونه‌ها	انسان	موش
Entrez	91746	231386
آنسامبل	ENSG00000275272 ENSG00000083896	ENSMUSG00000035851
یونی‌پروت	Q96MU7	E9Q5K9
RefSeq (mRNA)	NM_133370، XM_005265708، NM_001330698 NM_001031732، NM_133370، XM_005265708، NM_001330698	XM_006534863، XM_006534865، XM_006534867، XR_389269، XM_017320843، NM_001347375، NM_001347376، NM_001359907، NM_001359908، NR_153372، XM_030254395، XR_003955632، XR_004942503 NM_177680، XM_006534863، XM_006534865، XM_006534867، XR_389269، XM_017320843، NM_001347375، NM_001347376، NM_001359907، NM_001359908، NR_153372، XM_030254395، XR_003955632، XR_004942503
RefSeq (پروتئین)	NP_001317627، NP_588611، XP_005265764، XP_005265765، XP_016864321، XP_016864322 NP_001026902، NP_001317627، NP_588611، XP_005265764، XP_005265765، XP_016864321، XP_016864322	NP_001334305، NP_808348، XP_006534926، XP_006534928، XP_006534930، XP_017176332، NP_001346836، NP_001346837، XP_030110255 NP_001334304، NP_001334305، NP_808348، XP_006534926، XP_006534928، XP_006534930، XP_017176332، NP_001346836، NP_001346837، XP_030110255
موقعیت (UCSC)	ن/م	Chr : 86.95 – 86.98 Mb
جستجوی PubMed	[۲]	[۳]
ویکی‌داده
مشاهده/ویرایش انسان مشاهده/ویرایش موش

پروتئین شماره ۱ حاوی دومین YTH (انگلیسی: YTH domain-containing protein 1) یک پروتئین است که در انسان توسط ژن «YTHDC1» کُدگذاری می‌شود.^[۴][۵][۶]

این پروتئین با تیروزین-پروتئین کیناز CSK^[۷] و امرین^[۸] تعامل پروتئین-پروتئین دارد.

1. ↑ ^{۱٫۰ ۱٫۱ ۱٫۲} GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000035851 - Ensembl, May 2017
2. ↑ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
3. ↑ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
4. ↑ Stoilov P, Rafalska I, Stamm S (Oct 2002). "YTH: a new domain in nuclear proteins". Trends Biochem Sci. 27 (10): 495–7. doi:10.1016/S0968-0004(02)02189-8. PMID 12368078.
5. ↑ Hartmann AM, Nayler O, Schwaiger FW, Obermeier A, Stamm S (Dec 1999). "The interaction and colocalization of Sam68 with the splicing-associated factor YT521-B in nuclear dots is regulated by the Src family kinase p59(fyn)". Mol Biol Cell. 10 (11): 3909–26. doi:10.1091/mbc.10.11.3909. PMC 25688. PMID 10564280.
6. ↑ "Entrez Gene: YTHDC1 YTH domain containing 1".
7. ↑ Rafalska I, Zhang Z, Benderska N, Wolff H, Hartmann AM, Brack-Werner R, Stamm S (Aug 2004). "The intranuclear localization and function of YT521-B is regulated by tyrosine phosphorylation". Hum. Mol. Genet. 13 (15): 1535–49. doi:10.1093/hmg/ddh167. PMID 15175272.
8. ↑ Wilkinson FL, Holaska JM, Zhang Z, Sharma A, Manilal S, Holt I, Stamm S, Wilson KL, Morris GE (Jun 2003). "Emerin interacts in vitro with the splicing-associated factor, YT521-B". Eur. J. Biochem. 270 (11): 2459–66. doi:10.1046/j.1432-1033.2003.03617.x. PMID 12755701.