Endoribonukleaasit ovat hydrolaaseihin kuuluvia entsyymejä. Ne osallistuvat tarpeettoman tai virheellisen RNA-molekyylin hajottamiseen tekemällä kaksijuosteisen RNA:n yksijuosteiseksi RNA:ksi ja hajottamalla RNA-ketjun keskeltä pienemmiksi paloiksi. Lisäksi ne osallistuvat eräiden RNA-tyyppien modifikaatioon oikeanlaisen toiminnan varmistamiseksi. Endoribonukleaaseja esiintyy sekä esi- että aitotumaisissa soluissa.[1][2][3]
Endoribonukleaasien katsottiin aikaisemmin esiintyneen ainoastaan esitumaisissa soluissa kuten bakteerisoluissa ja aitotumaisten eliöiden RNA:n hajottamisesta katsottiin vastaavan ainoastaan eksoribonukleaasit. Myöhemmin on kuitenkin selvinnyt, että myös aitotumaisten eliöiden eksosomikompleksi sisältää endonukleaasiaktiivisuutta. Endonukleaasien tehtävänä on hydrolysoida RNA:n rakennetta stabiloivia sidoksia ja näin ne tekevät RNA:n alttiimmaksi eksoribonukleaasien katalysoimalle hydrolyysille. Endoribonukleaaseihin kuuluvat muun muassa ribonukleaasi A ja ribonukleaasi P.[1][2][3]