William John McNaughton (7. joulukuuta 1926 Lawrence, Massachusetts – 3. helmikuuta 2020)[1] oli Etelä-Koreassa toiminut yhdysvaltalainen roomalaiskatolinen piispa. Hänet vihittiin Catholic Foreign Mission Society of American papiksi 13. kesäkuuta 1953 ja nimitettiin Incheonin/Inch'onin apostoliseksi vikaariksi sekä Thuburbo Minuksen titulaaripiispaksi 6. kesäkuuta 1961.[1] Piispaksi vihkiminen seurasi 24. elokuuta. Pääkonsekraattorina toimi Richard James Cushing, jota avustivat John William Comber ja Petrus Canisius Jean van Lierde.[2]
McNaughton sai 10. maaliskuuta 1962 nimityksen Incheonin piispaksi, jona hän toimi, kunnes jäi eläkkeelle 25. huhtikuuta 2002. Hän osallistui Vatikaanin toiseen kirkolliskokoukseen.[2]