COVID-19 Genomics UK Consortium

COVID-19 Genomics UK Consortium
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Le COVID-19 Genomics UK Consortium (COG-UK) est un groupe d'agences de santé publique et d'institutions universitaires au Royaume-Uni créé en avril 2020[1],[2],[3] pour collecter, séquencer et analyser les génomes du SARS-CoV-2 dans le cadre de la réponse à la pandémie de COVID-19. Le consortium comprend les quatre agences de santé publique du Royaume-Uni, des organisations du National Health Service, des partenaires universitaires et le Centre Sanger. Le consortium est connu pour avoir identifié pour la première fois le variant Alpha du SARS-CoV-2 (à l'époque, appelée Variant of Concern 202012/01) en novembre 2020[4]. En janvier 2021, 45% de toutes les séquences du SRAS-CoV-2 téléchargées dans la base de données de séquençage GISAID provenaient du COG-UK[5],[6],[7].

En avril 2021, COG-UK a commencé la transition prévue du séquençage vers un service national, qui devrait s'achever d'ici septembre 2021[8]. COG-UK a déclaré que ses priorités après cette transition sont le couplage de données, la recherche et la formation internationale[9].

  1. (en-US) « UK launches whole genome sequence alliance to map spread of coronavirus », COG-UK Consortium, (consulté le )
  2. (en-US) Peacock, « A short history of the COVID-19 Genomics UK (COG-UK) Consortium », COG-UK Consortium, (consulté le )
  3. Gallagher, « Coronavirus to be tracked using its genetic code », www.bbc.co.uk, (consulté le ) : « The project - called the Covid-19 Genomics UK Consortium - is a collaboration between the NHS, public health agencies and the Wellcome Sanger Institute universities. Business Secretary Alok Sharma said: "This new consortium will bring together the UK's brightest and best scientists to build our understanding of this pandemic, tackle the disease and ultimately, save lives." »
  4. (en) Wise, « Covid-19: New coronavirus variant is identified in UK », BMJ, vol. 371,‎ , m4857 (ISSN 1756-1833, PMID 33328153, DOI 10.1136/bmj.m4857, lire en ligne Accès libre)
  5. (en) Cyranoski, « Alarming COVID variants show vital role of genomic surveillance », Nature, vol. 589, no 7842,‎ , p. 337–338 (DOI 10.1038/d41586-021-00065-4, lire en ligne)
  6. « In tracking Covid mutations, most countries flying blind », www.nst.com.my, (consulté le )
  7. (en-GB) « Bio-Britain is leading the world in the science of Covid », Daily Telegraph,
  8. « How SARS-CoV-2 sequencing is becoming a national service », COG-UK consortium
  9. « What next for COG-UK? »

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