La question de la capitale de la Suisse (en allemand Hauptstadtfrage der Schweiz) se pose depuis la Confédération des XIII cantons.
La première constitution fédérale, marquant l’avènement de l'État fédéral en 1848, indique que le choix du « siège des autorités fédérales » doit faire l'objet d'une loi. Trois villes sont candidates pour devenir ville fédérale, Zurich, Berne et Lucerne. Le choix de l'Assemblée fédérale (le parlement fédéral) se porte sur Berne, mais sans la doter du titre de capitale ; pouvoirs législatif et exécutif s'établissent ainsi dans le Mittelland. Le Tribunal fédéral, pouvoir judiciaire suprême de la Confédération, établit son siège à Lausanne et (plus tard) également Lucerne.
Dans un souci d'équité entre les régions, plusieurs villes accueillent d'autres autorités fédérales. Ainsi, le Tribunal administratif fédéral siège à Saint-Gall et le Tribunal pénal fédéral à Bellinzone. Zurich accueille le Musée national, la première école polytechnique fédérale et la première succursale de la Banque nationale.