Un cryptogame (du grec cryptos, « caché » et gamos, « union, fécondation, reproduction ») est un organisme végétal qui se caractérise par des organes reproducteurs cachés ou peu apparents, ce qui l'oppose aux phanérogames (du grec phaneros, « apparent ») : les plantes à graines.
Dans la classification botanique classique, les cryptogames étaient considérés comme l'un des deux embranchements du « règne végétal » ; l'autre était les phanérogames. Ensemble ils formaient le « règne végétal » dans la vision à « quatre règnes » du monde vivant (« règnes » minéral, bactérien, végétal et animal), mais ces notions ne sont plus adaptées aux classifications phylogénétiques issues de la cladistique.