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FASTQ
| Extension |
.fastq .fq |
|---|---|
| Type MIME |
text/plain |
| Signature | 40 53 45 51 5F 49 44 (hexa) |
| Développé par | |
| Version initiale | |
| Type de format | |
| Basé sur | |
| Origine de | |
| Spécification |
Le format FASTQ est un format de fichier texte permettant de stocker à la fois des séquences biologiques (uniquement des séquences nucléiques) et les scores de qualité associés. La séquence et le score sont chacune codées avec un seul caractère ASCII. Ce format a été initialement développé par le Wellcome Trust Sanger Institute afin de lier un fichier de séquence au format FASTA aux données de qualité correspondantes mais est récemment devenu le standard de facto pour le stockage des sorties de séquenceurs à haut débit[1].
- ↑ (en) Cock PJ., Fields CJ., Goto N., Heuer ML. & Rice PM., « The Sanger FASTQ file format for sequences with quality scores, and the Solexa/Illumina FASTQ variants. », Nucleic Acids Research, vol. 38, no 6, , p. 1767-71 (ISSN 1362-4962, PMID 20015970, DOI 10.1093/nar/gkp1137)