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en orange - ectoderme),
en rouge - endoderme (ou endoblaste).
La gastrulation correspond à la seconde phase de développement embryonnaire lors de laquelle la mitose est en continuel ralentissement. C'est la période durant laquelle les mouvements morphogéniques permettent le remaniement des blastomères qui se répartissent en deux ou trois feuillets : un feuillet externe (ectoderme), un feuillet moyen présent seulement chez les triploblastiques (mésoderme) et un feuillet interne (endoderme). La gastrulation, comme stade du développement embryonnaire de tous les animaux, a été découverte par Alexandre Kovalevski.
La gastrulation débute entre le 14e et le 15e jour du cycle cellulaire, elle est directement précédée de la segmentation et suivie par la neurulation.
Il y a différents types de gastrulation, selon la nature des œufs concernés. Il y a cinq types d'œufs : Les oligolécithes (ou alécithes), les hétérolécithes, les centrolécithes et les télolécithes.
Au début de la gastrulation, l'embryon possède une symétrie quasiment sphérique. À la fin, la symétrie fondamentale du groupe animal (radiaire, bilatérien) est mise en place. La façon dont se déroule la gastrulation aura donc des conséquences sur la morphologie de l'adulte, et permet de différencier les quatre grands phyla animaux. Cette période est décisive pour le développement de l'organisme, toute anomalie ayant lieu avant cette gastrulation conduisant à la mort de l'« embryon » : C'est une réaction dite en « tout ou rien ».