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Un riboswitch est un des systèmes de type riborégulateur. Il s'agit d'une structure d'ARN présente sur la partie amont (en 5'), non traduite, de certains ARN messagers. Un riboswitch comporte deux parties : l'aptamère (simple ou en tandem) et la plateforme d'expression. L'aptamère peut lier directement un ligand (une petite molécule) ce qui déclenche une modification de structure de la plateforme d'expression. Cette modification va influer sur l'expression du gène porté par l'ARNm en bloquant ou en activant la transcription ou la traduction de la protéine correspondante. Les riboswitches sont ainsi une des voies possibles de régulation de la traduction.
Très souvent, le ligand du riboswitch est un métabolite de la réaction catalysée par la protéine codée par l'ARNm, ce qui conduit à un mécanisme de rétroaction directe.
Les riboswitches ont été principalement observés chez les bactéries, bien qu'ils existent aussi chez certains plantes[2], champignons[3], phages[4] et archées[5]. Ils réguleraient ainsi une partie non négligeable du génome bactérien, par exemple environ 2 % du génome de B. subtilis est sous le contrôle de riboswitches[6].
- ↑ (en) Montange R.K., Batey R.T., « Structure of the S-adenosylmethionine riboswitch regulatory mRNA element », Nature, vol. 441, no 7097, , p. 1172-1175 (PMID 16810258)
- ↑ (en) Andreas Wachter, Meral Tunc-Ozdemir, Beth C. Grove et Pamela J. Green, « Riboswitch Control of Gene Expression in Plants by Splicing and Alternative 3′ End Processing of mRNAs », The Plant Cell, vol. 19, , p. 3437–3450 (ISSN 1532-298X, PMID 17993623, PMCID 2174889, DOI 10.1105/tpc.107.053645, lire en ligne, consulté le )
- ↑ (en) Ming T. Cheah, Andreas Wachter, Narasimhan Sudarsan et Ronald R. Breaker, « Control of alternative RNA splicing and gene expression by eukaryotic riboswitches », Nature, vol. 447, , p. 497–500 (ISSN 0028-0836, DOI 10.1038/nature05769, lire en ligne, consulté le )
- ↑ (en) N. Sudarsan, E. R. Lee, Z. Weinberg et R. H. Moy, « Riboswitches in Eubacteria Sense the Second Messenger Cyclic Di-GMP », Science, vol. 321, , p. 411–413 (ISSN 0036-8075 et 1095-9203, PMID 18635805, DOI 10.1126/science.1159519, lire en ligne, consulté le )
- ↑ (en) Zasha Weinberg, Joy X Wang, Jarrod Bogue et Jingying Yang, « Comparative genomics reveals 104 candidate structured RNAs from bacteria, archaea, and their metagenomes », Genome Biology, vol. 11, (PMID 20230605, PMCID 2864571, DOI 10.1186/gb-2010-11-3-r31, lire en ligne, consulté le )
- ↑ Maumita Mandal, Benjamin Boese, Jeffrey E. Barrick et Wade C. Winkler, « Riboswitches control fundamental biochemical pathways in Bacillus subtilis and other bacteria », Cell, vol. 113, , p. 577–586 (ISSN 0092-8674, PMID 12787499, lire en ligne, consulté le )