De lytse kapibara (Latynske namme: Hydrochoerus isthmius) is in sûchdier út it skift fan 'e kjifdieren (Rodentia), de famylje fan 'e kavia-eftigen (Caviidae) en it skaai fan 'e kapibara's (Hydrochoerus), dat foarkomt yn it uterste noardwesten fan Súd-Amearika en op 'e lâningte fan Panama. Hoewol't dit bist foar it earst wittenskiplik beskreaun waard yn 1912, troch de soölooch Edward Alphonso Goldman, waard it doe klassifisearre en lange tiid beskôge as in ûndersoarte fan 'e gewoane kapibara (Hydrochoerus hydrochaeris). Pas yn 1991 waard de lytse kapibara op grûn fan nij ûndersyk erkend as in selsstannige bistesoarte.