LTR retrotransposon

יש לשכתב ערך זה. הסיבה היא: כתיבה בשפה מדעית גבוהה ולא מובנת לקהל הרחב.
אתם מוזמנים לסייע ולתקן את הבעיות, אך אנא אל תורידו את ההודעה כל עוד לא תוקן הדף. ייתכן שתמצאו פירוט בדף השיחה.
יש לשכתב ערך זה. הסיבה היא: כתיבה בשפה מדעית גבוהה ולא מובנת לקהל הרחב.
אתם מוזמנים לסייע ולתקן את הבעיות, אך אנא אל תורידו את ההודעה כל עוד לא תוקן הדף. ייתכן שתמצאו פירוט בדף השיחה.
A. מבנה גנטי של LTR-retrotransposons (מסוג צועני). B. מנגנון של רטרו-טרנספוזיציה, שפועל בתוך חלקיקים דמויי וירוסים בציטופלסמה. שעתוק הפוך מתחיל בתחל של ה-tRNA של המארח, המשמש כאתר קישור (PBS), וממוקם מייד לאחר ה-5'LTR. עותק ה-cDNA השלילי המסונתז החדש של ה-5'LTR מועבר לאחר מכן ל-3'LTR ומשמש כתחל לשעתוק הפוך של מלוא הרצף של הגדיל השלילי. לאחר מכן מערכת פוליפורין עמידה ל-RNase H משמשת כתחל לסינתזה של הגדיל החיובי של ה-3'LTR, המשלים ל-PBS. גדיל ה-PBS החיובי שסונתז זה עתה מתחבר לגדיל ה-PBS השלילי שכבר סונתז, ולבסוף מיוצר cDNA דו-גדילי. לאחר מכן, ה-cDNA הדו-גדילי מועבר לגרעין על ידי חלבוני אינטגראז, ועותק חדש משולב בגנום.

רטרוטרנסופוני LTR הם תת-מחלקה (מחלקה 1) של אלמנטים ניידים (רטרוטרנסופוזונים) שמאופיינים על ידי נוכחות של LTR בקצוותיהם (כשבאמצע נמצא האזור המקודד).

כמו רטרו-וירוסים, גם רטרוטרנסופוני LTR עוברים שעתוק הפוך (מmRNA לDNA) ואז עוברים אינטגרציה של הcDNA החדש באזור אחר, אך בניגוד לרטרו-וירוסים, הם לא יוצרים חלקיקים מדבקים שעוזבים את התאים ולכן הם רק משתכפלים בתוך הגנום המקורי. אלה שכן מדי פעם יוצרים חלקיקים דמויי וירוס מסווגים בנפרד תחת אלמנטים אורט-ויראליים.

גודלם נע בין כמה מאות בודדות של זוגות בסיסים ל-25kb. בגנומים של צמחים, רטרוטרנספוזונים בעלי LTR הם הסוג העיקרי של רצפים חוזרניים, ומרכיבים מעל ל-75% מהגנום של תירס למשל[1]. לעומת זאת הם מרכיבים רק כ-8% מהגנום האנושי, ובערך 10% מהגנום העכברי[2].

  1. ^ Baucom, RS; Estill, JC; Chaparro, C; Upshaw, N; Jogi, A; Deragon, JM; Westerman, RP; Sanmiguel, PJ; Bennetzen, JL (בנובמבר 2009). "Exceptional diversity, non-random distribution, and rapid evolution of retroelements in the B73 maize genome". PLOS Genetics. 5 (11): e1000732. doi:10.1371/journal.pgen.1000732. PMC 2774510. PMID 19936065. {{cite journal}}: (עזרה)
  2. ^ McCarthy EM, McDonald JF (2004). "Long terminal repeat retrotransposons of Mus musculus". Genome Biol. 5 (3): R14. doi:10.1186/gb-2004-5-3-r14. PMC 395764. PMID 15003117.

From Wikipedia, the free encyclopedia · View on Wikipedia

Developed by Nelliwinne