Manuel III. Megas Komnenos (grčki: Μέγας Κομνηνός, Manouēl III Megas Komnēnos, 16. prosinca 1364. – 5. ožujka 1417.)[1] bio je car Trapezunta od 20. ožujka 1390. do svoje smrti 1417.
Glavni događaj Manuelove vladavine bio je dolazak srednjoazijskog osvajača Timura u Anadoliju. To je dovelo do skoro potpunog uništenja Osmanskog Carstva, koje je bilo prijetnja opstanku Manuelove države, u bitci kod Angore. Iako se država Osmanlija počela oporavljati nakon 10 godina građanskog rata, ovaj je poraz produžio život i sigurnost Trapezumtskog Carstva za još nekoliko desetljeća.