Stereokemija je poddisciplina kemije koja proučava prostorni raspored atoma koji tvore strukturu molekula i njihovu manipulaciju.[1] Proučavanje stereokemije usredotočeno je na odnose između stereoizomera, koji su definirani kao spojevi koji imaju istu molekulsku formulu i slijed vezanih atoma (konstituciju), ali se razlikuju u geometrijskom položaju atoma u prostoru. Iz tog razloga, također je poznata kao 3D kemija—prefiks "stereo-" znači "trodimenzionalnost".[2] Stereokemija se odnosi na sve vrste spojeva i iona, organske i anorganske vrste. Stereokemija utječe na biološku, fizikalnu i supramolekularnu kemiju.
Stereokemijska znantno utječe na reaktivnost kemijskih spojeva što je nama posebno bitno jer su biološki sustavi iznimno selektivni i vrlo često razlikuju molekule koje su tek neznatno sterekemijski različite.
Stereokemiju dijelimo na statičku i dinamičku stereokemiju.