Gejala sindrom Irukandji pertama kali didokumentasikan oleh Hugo Flecker pada tahun 1952.[3] Ubur-ubur ini diberi nama setelah suku Irukandji yang wilayahnya membentang di sepanjang jalur pantai utara Cairns, Queensland.[4] Yang pertama dari ubur-ubur ini, Carukia barnesi, diidentifikasi pada tahun 1964 oleh Jack Barnes; untuk membuktikan penyebab sindrom Irukandji, ia mengambil ubur-ubur kecil dan memungkinkan untuk menyengat dirinya, sementara anaknya dan penjaga pantai mengamati efeknya.[5][6]