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Il buffer TBE è una soluzione tampone usata nella preparazione di gel elettroforetici di agarosio per la separazione di frammenti di DNA risultanti dall'amplificazione di PCR, da protocolli di purificazione e da esperimenti di clonaggio.
È composto da una soluzione di Tris-borato-EDTA, e l'EDTA sequestra i cationi bivalenti. Il buffer TBE è particolarmente utile nella separazione di piccoli frammenti di DNA (peso molecolare < 1000), ad esempio piccoli prodotti risultanti dalla digestione con enzimi di restrizione.
Il TBE ha una migliore capacità tamponante e fornisce una più accurata risoluzione del buffer TAE. Il TBE è generalmente più costoso del TAE e inibisce la DNA ligasi che può causare problemi nel caso si volesse procedere con la purificazione o la ligazione del DNA.