Filadelfia nella guerra di secessione americana fu un importante fonte e centro di smistamento per truppe, finanziamenti, armi, assistenza medica e rifornimenti di materiali di supporto per l'Unione.
Prima dello scoppio della guerra civile i suoi stretti rapporti economici con il profondo Sud resero la maggior parte della classe imprenditoriale della città solidale con le lamentele espresse nei riguardi del Nord e in particolare della Nuova Inghilterra; una volta che il conflitto ebbe preso il via però l'opinione pubblica di molti filadelfiani si spostò a sostegno della legittima Presidenza di Abraham Lincoln e della guerra contro gli Stati Confederati d'America.
Oltre 50 reggimenti tra fanteria e cavalleria vennero reclutati in tutto o in parte a Filadelfia. Il centro urbano, forte polo industriale diverrà velocemente la principale fonte di divise per l'Union Army; producendo anche armi e costruendo navi da battaglia grazie ai propri cantieri navali. Fu inoltre la sede dei due più grandi ospedali militari statunitensi: il Satterlee General Hospital e il Mower U.S. Army General Hospital.
Nel 1863 venne direttamente minacciata dall'invasione sudista nel corso della Campagna di Gettysburg. Furono scavate opere di trinceramento a difesa della città e alla fine l'esercito avversario venne respinto prima a Wrightsville (Pennsylvania) e subito dopo alla battaglia di Gettysburg.
L'eredità principale del conflitto fu l'ascesa del Partito Repubblicano; disprezzato precedentemente a causa della sua posizione apertamente anti-schiavismo, la nuova forza politica produsse un clientelismo tale il quale avrebbe dominato la vita pubblica per quasi un secolo a venire.
