Situata nell'Europa sud-orientale, la Moldavia confina ad ovest con la Romania e a nord, sud ed est con l'Ucraina; è uno stato senza sbocco al mare. La maggior parte del suo territorio sorge nell'area compresa tra i due fiumi principali, il Nistro e il Prut. Il primo forma una piccola parte della frontiera moldava con l'Ucraina nel nord-est, ma scorre principalmente attraverso la parte orientale del paese, separando la Bessarabia dalla Transnistria. Il Prut forma invece l'intero confine occidentale con la Romania. Il confine moldavo è anche toccato dal Danubio, nella sua parte meridionale, e forma il confine per meno di mezzo chilometro.
La RSS Moldava era la seconda più piccola tra le repubbliche che formavano l'Unione Sovietica, ma era la più densamente popolata. L'economia moldava assomiglia più a quella delle repubbliche dell'Asia centrale, piuttosto che a quella degli altri stati all'estremità occidentale dell'ex URSS.