Johannes Bouwmeester (Amsterdam, 4 novembre 1634 – 22 ottobre 1680) è stato un medico e filosofo olandese.
Amico intimo di Lodewijk Meyer, di Adriaen Koerbagh e di Baruch Spinoza, appartenne alla ristretta cerchia che curò la pubblicazione dell'Ethica. Con Meyer cofondò la società Nil volentibus arduum.[1]