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Johannes Buxtorf (Kamen, 25 dicembre 1564 – Basilea, 13 settembre 1629) è stato un ebraista e docente tedesco, che insegnò ebraico per 39 anni all'Università di Basilea.
Membro di una famiglia di orientalisti, Buxtorf fu noto con il titolo di "Maestro dei Rabbini". Il suo volume corposo De Synagoga Judaica (I edizione, 1603) documenta scrupolosamente i costumi e la società degli ebrei tedeschi a partire dall'età moderna.
Buxtorf fu il padre di Johannes Buxtorf il Giovane.