Joseph Baumgarten (Vienna, 7 settembre 1928 – Gerusalemme, 16 dicembre 2008) è stato un archeologo austriaco naturalizzato statunitense.
È stato uno dei massimi studiosi dei Rotoli del Mar Morto e della comunità giudaica di Qumran ed è considerato uno dei più illustri specialisti di studi biblici sulla legge giudaica (halakhah). Si è in particolare interessato dei contenuti giuridici dei Rotoli del Mar Morto.
Fu uno dei pionieri nel campo delle ricerche sulla comunità degli Esseni, che visse nei pressi delle grotte di Qumran a partire dal II secolo a.C.