Masakan Khmer (Jawi: ماسقن خمر ; Khmer: សិល្បៈខាងធ្វើម្ហូបខ្មែរ ) adalah suatu nama jolokan untuk makanan yang dimakan secara meluas di Kemboja. Makanan Kemboja termasuk buah-buahan tropika, nasi, mi, minuman, pencuci mulut dan pelbagai sup.
Makanan ruji untuk orang Kemboja ialah nasi. Hampir semua hidangan disertai semangkuk nasi, walaupun mi juga popular. Beraneka jenis kari, sup dan gorengan kilas dihidangkan bersama nasi. Banyak jenis beras boleh didapati di Kemboja, termasuk beras wangi dan beras pulut. Beras pulut lebih lazim digunakan dalam pencuci mulut dengan buah seperti durian.
Khmer Masakan berkongsi banyak persamaan dengan makanan jirannya iaitu Thailand, walaupun ia biasanya tidak pedas; dan Vietnam, yang berkongsi banyak hidangan lazim dan sejarah kolonial, kedua-duanya sebahagian daripada empayar kolonial Perancis di Asia Tenggara. Ia juga telah menarik pengaruh daripada masakan China dan Perancis, kedua-duanya memberikan peranan yang kuat dalam sejarah Kemboja. Hidangan kari (in Khmer, ការី ) menunjukkan kesan pengaruh budaya dari India. Banyak variasi mi beras menunjukkan pengaruh daripada Masakan Cina. Sup mi beras, yang dikenali hanya sebagai Kuyteav (គុយទាវ ), adalah hidangan popular dibawa ke Kemboja oleh peneroka Cina dari generasi yang lalu. Juga, Banh Chiao adalah Bánh xèo versi Khmer di Vietnam. Legasi Perancis adalah baguette, yang rakyat Kemboja sering makan dengan pâté, sardin tin atau telur. Salah satu daripadanya dengan secawan kopi pekat, manis dengan susu pekat, adalah satu contoh sarapan biasa Kemboja.
Biasanya, Kemboja makan makanan mereka dengan sekurang-kurangnya tiga atau empat hidangan berasingan.Juadah biasanya akan termasuk sup, atau samlor, disajikan bersama hidangan utama. Setiap hidangan individu akan sama ada manis, masam, masin atau pahit. Chili biasanya terserah kepada individu untuk menambah sendiri. Dengan cara ini rakyat Kemboja memastikan mereka mendapat sedikit setiap perisa untuk memenuhi selera mereka.
Beberapa kursus memasak kini diadakan di kawasan-kawasan pelancongan popular, memberikan pengunjung peluang untuk berkongsi rahsia masakan yang Khmer.