Pfam

Pfam
Kandungan
PerihalanPangkalan data Pfam menyediakan penjajaran dan model Markov tersembunyi untuk domain protein.
Jenis data
diperoleh
Keluarga protein
Organismasemua
Perhubungan
Pusat penyelidikanEBI
Kutipan utamaPubMed
BahasaBahasa Inggeris Sunting nilai ini di Wikidata
Capaian
Format dataFormat Stockholm
Tapak webwww.ebi.ac.uk/interpro
URL muat turunFTP
Teknikal
LesenLesen Awam Am Lemah GNU
Versi36.0
Entiti penandaya
sunting · sunting di Wikidata
Lihat pendokumenan templat ini
Lihat pendokumenan templat ini


Pfam ialah pangkalan data keluarga protein yang merangkumi anotasi protein serta penjajaran jujukan berbilang yang dijana menggunakan model Markov tersembunyi.[1][2][3] Versi terbaharu, Pfam 36.0, telah dikeluarkan pada September 2023 dan mengandungi 20,795 keluarga.[4]

  1. ^ "The Pfam protein families database". Nucleic Acids Res. 36 (Database issue): D281–8. 2008. doi:10.1093/nar/gkm960. PMC 2238907. PMID 18039703.
  2. ^ Finn, R. D.; Mistry, J.; Schuster-Böckler, B.; Griffiths-Jones, S.; Hollich, V.; Lassmann, T.; Moxon, S.; Marshall, M.; Khanna, A. (Jan 2006). "Pfam: clans, web tools and services" (Free full text). Nucleic Acids Research. 34 (Database issue): D247–D251. doi:10.1093/nar/gkj149. ISSN 0305-1048. PMC 1347511. PMID 16381856.
  3. ^ Bateman, A.; Coin, L.; Durbin, R.; Finn, R. D.; Hollich, V.; Griffiths-Jones, S.; Khanna, A.; Marshall, M.; Moxon, S. (2004). "The Pfam protein families database". Nucleic Acids Research. 32 (Database issue): 138D–1141. doi:10.1093/nar/gkh121. ISSN 0305-1048. PMC 308855. PMID 14681378. penerbitan akses terbuka - percuma untuk dibaca
  4. ^ "Pfam 36.0 release". Xfam Blog. 2023-09-18. Dicapai pada 2023-11-24.

From Wikipedia, the free encyclopedia · View on Wikipedia

Developed by Nelliwinne