De 24 uur van Daytona 1999 was de 37e editie van deze endurancerace. De race werd verreden op 30 en 31 januari 1999 op de Daytona International Speedway nabij Daytona Beach, Florida.
De race werd gewonnen door de Dyson Racing #20 van Butch Leitzinger, Andy Wallace en Elliott Forbes-Robinson. Voor Leitzinger en Wallace was het hun derde Daytona-zege, terwijl Forbes-Robinson zijn tweede overwinning behaalde. De GT3-klasse werd gewonnen door de Team Seattle/Alex Job Racing #23 van Kelly Collins, Cort Wagner, Anthony Lazzaro en Darryl Havens. De GT2-klasse werd gewonnen door de Roock Racing #83 van André Ahrlé, Raffaele Sangiuolo, David Warnock en Hubert Haupt. De GTT-klasse werd gewonnen door de SK Group Motorsports #19 van Kyle McIntyre, Gary Stewart, Andy Petery, Craig Carter en Les Delano.
