Johann Jakob Scheuchzer (Zürich, 2 augustus 1672 – aldaar, 23 juni 1733) was een Zwitsers arts en natuuronderzoeker, bekend vanwege zijn onderzoek naar fossielen, die hij als overblijfselen van de zondvloed zag (zondvloedgeologie). Hij wordt gezien als een van de grondleggers van de moderne kristallografie en de paleobotanie.