Een kerkschip of kapelboot is een schip dat het pastoraat voor zeevissers en scheepvaart of in kustgebieden faciliteert.
Hoewel het bezoek aan de kerkschepen in West-Europa sterk teruggelopen is zijn er anno 2012 her en der in Europa nog kerkschepen in gebruik, zoals het Antwerpse Kerkschip Sint-Jozef, de Luikse kapelboot Emmaüs en de 'schipperskerk' Je Sers in Conflans-Sainte-Honorine. Dit zijn stilliggende schepen, in tegenstelling tot de vier hospitaal-kerkschepen De Hoop die tussen 1898 en 1988 op de Noordzee voeren. De kerkschepen in België vallen onder het Schippersapostolaat, dat ressorteert onder het aartsbisdom Mechelen.