Repeated sequence (genetica)

Repeated sequences, repeats, repetitieve elementen, repetitief-DNA of repetitief-RNA zijn DNA- of RNA-patronen, die in meerdere kopieën in het genoom voorkomen. Het eerste repetitief-DNA werd ontdekt door de snelle vorming van dubbelstrengig DNA.

In veel organismen bestaat een belangrijke gedeelte van het genoom uit repetitieve elementen. Bij mensen is dit twee derde van het genoom.^[1]

Repetitieve elementen kunnen afhankelijk van hun manier van vermeerdering en/of structuur ingedeeld worden in verschillende klassen. De repetitieve elementen bestaan uit een rij van tandem repeated sequences (tandem repeats, korte herhalingen achter elkaar) of zijn verspreid over het genoom. Microsatellieten (SSR - Simple Sequence Repeats) bestaan uit korte stukjes niet coderend (niet voor eiwitsynthese zorgend) DNA, die echter soms wel een duidelijke functie hebben. Repetitieve Alu-sequenties zijn repetitieve DNA-sequenties in genomen van primaten, die behoren tot de SINEs (Short interspersed nuclear elements). Repetitief centromeer satelliet-RNA is essentieel voor de kinetochoorvorming en celdeling.^[2] Satelliet RNA komt ook voor bij virussen. Zo heeft het komkommermozaïekvirus satelliet-RNA dat 332 - 405 nucleotiden lang is. Dit satelliet-RNA is nodig voor de vermeerdering, de vorming van de eiwitmantel en de verspreiding van het virus.^[3]

1. ↑ de Koning, AP Jason, et al. (2011). Repetitive elements may comprise over two-thirds of the human genome. PLoS Genet 7 (12): e1002384. DOI: 10.1371/journal.pgen.1002384.
2. ↑ S. Rošić, F. Köhler, S. Erhardt (2014). Repetitive centromeric satellite RNA is essential for kinetochore formation and cell division.. J Cell Biol 207 (3): 335-49. PMID 25365994. DOI: 10.1083/jcb.201404097.
3. ↑ Ping Xu and Marilyn J. Roossinck (2000). Cucumber Mosaic Virus D Satellite RNA–Induced Programmed Cell Death in Tomato. The Plant Cell 12 (7): 1079-1092. DOI: 10.1105/tpc.12.7.1079.