Het wapen van Bunnik is in 1913 voor het eerst door de Utrechtse gemeente aangevraagd, terwijl deze al in 1857 bestond. In 1857 is de gemeente Bunnik gefuseerd met de gemeente Rhijnauwen. In 1964 is de gemeente gefuseerd met onder andere Odijk, 4 jaar later kreeg de gemeente het huidige wapen, met in de vier kwartieren de drie oude wapens plus het voormalige wapen van de heerlijkheid Amelisweerd.