Transmisyjny mikroskop elektronowy (TEM, z ang. transmission electron microscope) – rejestrowane są elektrony przechodzące przez próbkę. Próbką w takim mikroskopie musi być cienka płytka o grubości rzędu setek nanometrów[1]. Przygotowanie takiej próbki jest trudne i znacznie ogranicza zastosowania mikroskopu.