Evangelion se passa quinze anos após um cataclismo mundial, particularmente na futurística cidade fortificada de Tokyo-3. O protagonista é Shinji, um adolescente que foi recrutado por seu pai, Gendo, para uma misteriosa organização chamada Nerv para pilotar em combate uma biomáquina gigante conhecida como "Evangelion" contra seres chamados "Anjos". A série explora as experiências e emoções dos pilotos dos Evangelions e membros da Nerv enquanto tentam evitar que os Anjos causem mais cataclismos. No processo, eles são chamados a compreender as últimas causas dos eventos e os motivos da ação humana. A série foi descrita como uma desconstrução do gênero mecha[4] e apresenta imagens arquetípicas derivadas da cosmologia xintoísta, bem como das tradições místicas judaicas e cristãs, incluindo contos midrashicos e da cabala. As teorias psicanalíticas de Freud e Jung também aparecem com destaque.[5][6]
Neon Genesis Evangelion foi aclamado pela crítica, mas também gerou polêmica,[7] com destaque para os dois últimos episódios, que são particularmente controversos. Em 1997, Anno e o Gainax lançaram o longa-metragem The End of Evangelion, mostrando o final de uma perspectiva diferente. A série original levou ao renascimento da indústria do anime e se tornou um ícone cultural. Filmes, mangás, home videos e outros produtos da franquia Evangelion alcançaram vendas recordes nos mercados japoneses e fortes vendas nos mercados internacionais, com produtos relacionados vendendo mais de 150 bilhões de ienes em 2007 e máquinas de pachinko relacionados a série vendendo 700 bilhões de ienes por volta de 2015.